Bien que les grilles classiques soient les plus communes, plusieurs variantes existent :
- 4x4 contenant des régions 2x2 (généralement pour les enfants)
- 5x5 contenant des régions en forme de pentamino ont été publiés sous le nom Logi-5
- 6x6 contenant des régions 2x3 (proposée lors du World Puzzle Championship)
- 7x7 avec six régions en forme d'hexamino et une région disjointe (proposée lors du World Puzzle Championship)
- 9x9 avec des régions en forme de ennéamino
- 16x16 avec des régions 4x4 (appelées Number Place Challenger et publiées par Dell, ou appelées parfois Super Sudoku)
- 25x25 avec des régions 5x5 (appelées Sudoku the Giant et publiées par Nikoli)
- une variante impose de plus que les chiffres dans les diagonales principales soient uniques. Le Number Place Challenger, mentionné précédemment, et le Sudoku X du Daily Mail, une grille 6x6, appartiennent à cette catégorie
- 8x8 contenant des régions 2x4 et 4x2, et où les rangées, les colonnes, régions et les diagonales principales contiennent un chiffre unique
- une méta-grille composée de cinq grilles 9x9 en quinconce qui se chevauchent aux coins est publiée au Japon sous le nom de Gattai 5 (qui signifie " cinq fusionnés ") ou Samuraï. Dans le journal The Times, cette forme est appelée le Samurai Su Doku.
- des grilles à régions rectangulaires : si une région est de dimensions LxC cases, la grille globale se décompose en CxL régions ; les valeurs à remplir vont alors de 1 à CxL
- Dion Church a créé une grille 3D, que le Daily Telegraph a publiée en mai 2005.
Des variantes alphabétiques, qui utilisent des lettres plutôt que des chiffres, sont aussi publiées.
The Guardian les appelle
Godoku et les qualifie de démoniaques.
Knight Features lui préfère le terme
Sudoku Word. Le
Wordoku de
Top Notch dévoile les lettres, dans le désordre, d'un mot qui court du coin gauche supérieur au coin droit inférieur. Un joueur ayant une bonne culture peut le trouver et utiliser sa découverte pour avancer vers la solution.
Le
Code Doku conçu par Steve Schaefer contient une phrase complète, alors que le
Super Wordoku de
Top Notch contient deux mots de neuf lettres, chacun se trouvant sur l'une des diagonales principales. Ces jeux ne sont pas considérés comme de vrais Sudoku par les puristes, car la logique n'est pas suffisante pour les résoudre, même s'ils ont une solution unique.
Top Notch affirme que ces jeux sont conçus de façon à bloquer les solutions composées par des logiciels de résolution automatique.
Au Japon, d'autres variantes sont publiées. En voici une liste incomplète :
- Grilles connectées séquentiellement : plusieurs grilles 9x9 sont résolues consécutivement, mais seul la première a suffisamment de dévoilés pour permettre de résoudre logiquement. Une fois résolue, certains chiffres sont copiés vers le suivant. Cette formule impose au joueur de faire des allers et des retours entre des grilles partiellement résolues.
- Grilles très grandes qui consistent en de multiples grilles qui se chevauchent (habituellement 9x9). Des grilles constituées de 20 à 50, ou plus, sont courantes. La taille des régions qui se chevauchent varie (deux grilles 9x9 peuvent partager 9, 18 ou 36 cellules). Souvent, il n'y a aucun dévoilé dans ces régions.
- Grilles habituelles où un chiffre est membre de quatre groupes, au lieu des trois habituels (rangées, colonnes et régions) : les chiffres situés aux mêmes positions relatives dans une région ne doivent pas correspondre. Ces grilles sont habituellement imprimées en couleur, chaque groupe disjoint partageant une couleur pour faciliter la lecture.
La trousse de jeux pour participer au
World Puzzle Championship de 2005 contient une variante intitulée
Digital Number Place : plutôt que de contenir des dévoilés, la plupart des cellules contiennent un chiffre partiellement dessiné qui emprunte à la graphie de l'affichage à sept segments.
Le 31 août 2005,
The Times a entamé la publication du
Killer Su Doku, aussi nommé
Samunamupure (qui signifie " lieu de sommation "), lequel indique la somme de cellules regroupées, ce qui ajoute un supplément de difficulté dans la recherche de la solution, bien que cela puisse aider à résoudre. Les autres règles s'appliquent.
La plupart des journaux proposent aujourd'hui une grille de Sudoku dans leur page de jeux.